中国农科院农业基因组研究所简介

中国农业科学院（深圳）农业基因组研究所（简称“基因组所”）是由中国农业科学院和深圳市共同打造的国家级研究所，主要从事生物大数据分析和基因组学研究，建立了分子生物学、测序和高性能计算三大平台。研究所自2014年成立以来，践行“跃居世界农业科技高端，服务产业重大科技需求”国家使命，服务于粤港澳大湾区战略部署和深圳市国际科技产业创新中心建设，平台测序通量和计算能力均为全国农口单位最大，并依托研究平台为全国60多家农业科研单位提供基因组学服务，积累数据量超过2PB。组建了包括国家杰青等80余位高层次人才的近1000人的科研队伍，累计招收博士后130多名；建设了以组学技术为核心、辐射农业、食品健康和生态方向的学科体系；获批“岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心”等创新载体；在Science, Nature, Cell, Nature Genetics等知名期刊上发表SCI论文400余篇，授权专利近50项。2019年、2020年连续两年自然指数排名全国农业类科研院所第一名；多项成果入选“中国生命科学十大进展”、“中国农业科学十大进展”、“‘十三五’农业科技十大标志性成果”；获得“何梁何利基金”奖、“周光召基础科学奖”、“深圳经济特区建立40周年创新创业和先进模范人物”、“深圳市市长奖”等奖励。

基因组所下设食品科学中心，基于人类健康和食品组学大数据，围绕“健康与食品”的关系，致力于三大研究主题：食品组学、肠道宏基因组与健康、人对食物性状感知的机理。为推动产学研融合，中心正在筹建四大支持平台：国际食品谷联盟（产业孵化平台），食品安全标准实验室（实验室测试平台），国际食品政策智库（专家顾问平台），以及集成数据管理系统（组学数据管理平台）。此外，基因组所联合深圳市相关部门提出了“深圳国际食品谷”规划，已得到市政府印发，将构建食品产学研协作生态，做出科技推动食品产业转型升级的先行示范。以建立世界食品科技创新策源地和未来食品健康先行示范区为目标，深圳国际食品谷重点围绕健康营养、食品安全、未来农业三大领域，汇聚一批国际一流大学和科研院所，以及一流企业（研发）总部基地，营造未来产学研的协作创新生态，为大湾区和国家提供食品安全的重要支撑和推动食品产业的转型升级，成为全球食品科技原始创新中心。

课题组简介

贾耿介，中国农业科学院农业基因组研究所，食品科学中心研究员、博士生导师、中国农业科学院青年英才、深圳海外高层次人才、国际计算生物学协会(ISCB)会员、中国生物工程学会终身会员。2008年于中国科学技术大学取得生物科学学士学位，2013年在新加坡国立大学和麻省理工学院联合培养项目取得生物信息学博士学位。2011年在苏黎世联邦理工学院访问学习；2013–2016，担任CGG公司数据科学家；2016–2020，在芝加哥大学医学院进行医学信息学博士后研究工作。近十年来共发表研究论文19篇，其中以第一作者在Nature Communications、Metabolites、BMC Systems Biology、Bioinformatics等学术期刊发表论文7篇。

研究领域包括健康与营养大数据挖掘、生物医学信息学、人工智能生物学、健康表型组与基因组数据分析、生物分子网络建模。

通过开发针对多维度健康组学大数据的统计分析和机器学习方法，开展如下研究：

1.识别疾病的亚型分组和特异的并发症模式，解析其病理学基础，设计体外诊断和个性化营养干预方案；

2.阐释疾病并发规律，解析其遗传和饮食风险，建立疾病并发的风险预测模型。

课题组介绍网页：https://www.jialab.org.cn

研发团队现有18人，包括副研究员1名，博士后3名，博士研究生3名，硕士研究生7名，科研助理4名。团队成员以生物信息和数学统计专业为主，还包括生物化学、食品科学、营养学等专业毕业生；团队成员具有较强的数学建模和算法开发能力，并能通过细胞分子实验进行假设验证和分子机理探索。

招聘岗位：博士后

招聘需求：

面向生物信息学、计算机科学、生物统计、公共卫生、医学、营养学、数学方向，诚聘博士后3名、助理研究员1-2名、副研究员1名。

应聘条件：

1.具有博士学位；

2.有代表性学术成果发表于国际重要刊物者优先；

3.学术严谨，勤于思考，善于合作，有良好的沟通和中英文科技写作能力。

岗位待遇：

1.博士后：按照深圳市、大鹏新区相关规定，博士后在站期间享受在站博士后生活补贴，具体金额以政府最新规定为准（税后36万元，分2-3年发放）；除此之外，按照研究所的相关规定提供博士后的额外生活补助，6-8万/年；

2.助理研究员：按照研究所相关规定和个人条件，14-20万/年；

3.副研究员：按照研究所相关规定和个人条件，22-35万/年；

4.五险一金和绩效待遇；

5.可选择落户深圳市，其配偶及未成年子女可办理随迁入户，并且享受深圳市和大鹏新区的新引进人才生活补贴，具体金额和发放方式以政府最新规定为准；

6.符合条件者，可被认定为深圳市人才，获得人才奖励，认定标准和奖励金额以政府最新规定为准。

应聘方式

请将个人简历（包含教育经历、研究经历、发表论文）、代表作和研究意向（或详细计划）以电子邮件形式发送到jiagengjie@caas.cn，并抄送znkyjyz@163.com，邮件主题请命名为“应聘博后／助理研究员／副研究员+姓名”。

对所有应聘材料，我们会严格保密。课题组在收到申请材料一个月内会与初审合格者E-mail或电话联系，邀请进行面试；资格审查未通过者，不再另行告知。

PI代表论文:

1.G. Jia, Y. Li, H. Zhang, I. Chattopadhyay, A. B. Jensen, D. R. Blair, L. Davis, P. N. Robinson, T. Dahlén, S. Brunak, M. Benson, G. Edgren, N. J. Cox, X. Gao, A. Rzhetsky*, Estimating Heritability and Genetic Correlations from Large Health Datasets in the Absence of Genetic Data, Nature Communications, 10, 5508 (2019).   (*corresponding authors)

2.G. Jia, G. Stephanopoulos, R. Gunawan*, Ensemble Kinetic Modeling of Metabolic Networks from Dynamic Metabolic Profiles, Metabolites, 2 (4), 891–912 (2012).

3.G. Jia, G. Stephanopoulos, R. Gunawan*, Incremental Parameter Estimation of Kinetic Metabolic Network Models, BMC Systems Biology, 6, 142 (2012).

4.G. Jia, G. Stephanopoulos, R. Gunawan*, Parameter Estimation of Kinetic Models from Metabolic Profiles: Two-phase Dynamic Decoupling Method, Bioinformatics, 27 (14), 1964–1970 (2011).

5.B. Chicoine, A. Rivelli, V. Fitzpatrick*, L. Chicoine, G. Jia, A. Rzhetsky, Prevalence of Common Disease Conditions in a Large Cohort of Individuals with Down Syndrome in the United States, Journal of Patient-Centered Research and Reviews, 2021, 8(2): 86-97.

6.X. Zhong*, Z. Yin, G. Jia, D. Zhou, Q. Wei, A. Faucon, P. Evans, E. R. Gamazon, B. Li, R. Tao, A. Rzhetsky, L. Bastarache, N. J. Cox*, Electronic Health Record Phenotypes Associated with Genetically Regulated Expression of CFTR and Application to Cystic Fibrosis, Genetics in Medicine, 22, 1191–1200 (2020).

7.C. Zhang, H. Tu, G. Jia, T. Mukhtar, V. Taylor, A. Rzhetsky, S. Tay*, Ultra-multiplexed Analysis of Single-cell Dynamics Reveals Logic Rules in Differentiation, Science Advances, 5 (2019).

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